动物的福利和健康正变得越来越重要。近年来政治激进分子和紧张的游说，已经农业的这个方面变得至关重要。当然健康和福利本来就应该在优先列表的最上面，一个健康的动物还能生产健康的后代和具备更高的生产能力，不论是肉还是奶。而且，随着人们呼吁禁止在动物日粮中经常使用抗生素，当这些添加剂被禁用的时候，导致了生产中疾病增多。
天然的非抗生素生长促进剂
犊牛健康和生长不光受环境影响，还受营养的影响。通常犊牛面临呼吸道疾病挑战，这常常导致疾病状态。多年来，人们在代乳料和犊牛料中添加抗生素，认为这种添加剂会减少呼吸道疾病和其它疾病的发病率。随着合成产品被禁用或被严格限制使用，生产者正在寻找能为动物提供健康包含的非抗生素添加剂。研究显示来自酵母的糖类对奶牛犊牛具有显著效果。实验结果显示通过改善免疫系统功能和减少下痢，动物的呼吸道疾病发病率降低，健康性状改善。
硒营养状况
知道最近，人们还只是在动物饲料中广泛添加无机形式的硒源。现在，生产者通过添加使用有机形式的、高利用率的形式的硒 - 这种必需微量元素 - 并能从中受益。 缺硒很少引起人们注意，常常被忽视，但是它很可能引起繁殖失调并造成重大损失 - 如胎衣不下、子宫炎和卵巢囊肿 - 以及免疫力低下。乳房炎和体细胞数过高也可能受缺硒影响。犊牛体弱和生产性能不良也是典型的症状。
微量元素和动物健康
养殖生产要赚钱，就要求生产管理者必须将感染、疾病、繁殖/被毛/肢蹄问题的发生率降到最低。达到这一目的的一种办法是保证反刍动物得到平衡和有效的矿物元素营养。对于奶牛来说，锌在角蛋白的形成中发挥着关键作用。角蛋白是象蜡一样附着在乳导管内侧的层状结构，形成抵御外来细菌的屏障。每次挤奶的时候，这一层角蛋白中的一部分都会被冲刷下来，需要重新补充。如果锌供应不足，这一过程受阻，就会发生乳头房感染。角蛋白和锌同样对蹄甲的再生也很重要。铜在铁转运、肌肉蛋白生成和酶激活过程中扮演重要角色。
霉菌毒素污染
霉菌毒素是霉菌产生的有毒产物，在多种饲料原料中经常生成。霉菌毒素的高发生频率和浓度显示奶牛会经常采食到霉菌毒素，造成亚临床症状，导致生产性能下降。通常只能检测到较低水平的霉菌毒素，导致亚健康水平的奶产量下降、疾病发生几率和严重程度增加、繁殖性能下降。在某些时候，饲料总霉菌毒素浓度高到足以引起严重问题。对奶牛的影响取决于日粮中霉菌毒素的水平、采食中毒日粮的持续时间、以及霉菌毒素与可能刺激或加强中毒反应的其它霉菌毒素或应激源的互作。这里说的应激源包括疾病、产犊应激、热应激、营养不良或过剩、酸中毒、以及生产应激。